Extremely low genetic diversity in a circumpolar dragonfly species, Somatochlora

Gestart door hanscvanleeuwen, november 05, 2018, 21:47:38 PM

Vorige topic - Volgende topic

hanscvanleeuwen

Voor diegene die fylogenie aan de hand van DNA leuk vinden deze keer : Toendraglanslibel

Extremely low genetic diversity in a circumpolar dragonfly species, Somatochlora sahlbergi (Insecta: Odonata: Anisoptera)

https://www.nature.com/articles/s41598-018-32365-7

Je kunt je afvragen of gebrek aan COI variatie zoveel conclusies in de discussie rechtvaardigt (oa Panmictic). Met name omdat er eerder ook al gebrek aan COI variatie in Pantala flavescens waargenomen is (door dezelfde auteur). Tijd voor andere markers?
https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0148949

Gr Hans

pdeknijff

Hi Hans,
Je hebt helemaal gelijk.
COI kan erg variabel zijn, maar ook helemaal niet.
Het is zelfs zo dat verschillende mtDNA genen in dezelfde exemplaren (van wat dan ook) sterk uiteenlopende variatie patronen kunnen hebben.
Alle grote witkoppige meeuwen op het noordelijk halfrond zijn met COI niet te onderscheiden terwijl dat met CYTB of ND2 een koud kunstje is.
Een van de oorzaken is een uiterst subtiel maar effectief selectieproces waarvan we nog lang niet alles begrijpen.
Regulatie van temperatuur, zuurstof transport en energie huishouding zijn sterk afhankelijk van eiwitcomplexen waarin mtDNA gecodeerde genen een cruciale rol spelen.
Er lijkt interactie met de omgeving te zijn (veel of weinig zuurstof, denk aan hoogteverschillen) en temperatuur (arctisch of tropisch of juist gematigd), maar dit complex is erg weerbarstig en laat zich slecht ontrafelen en bestuderen.
De essentie is wel dat, bij gebrek aan COI variatie je geen harde conclusies kunt trekken.
Dat is dan ook de reden dat meer en meer complete mtDNA genomen worden gebruikt, liefst in combinatie met zo veel mogelijk autosomale informatie.
Dit verhaal kan dus inderdaad volslagen onzin zijn.
Het is dus wachten op veel meer genetische informatie.
gr,
Peter de Knijff

Met vriendelijke groet,

Peter de Knijff