Missing species, do it yourself, Missende soorten ? handen uit de mouwen

Gestart door hiskodevries, december 15, 2022, 09:58:23 AM

Vorige topic - Volgende topic

hiskodevries

From now on, anyone can add new species to Observation.org
Birds, mammals and plants are excluded from this system
You open the link and enter the genus or species name. After pressing ok an api to GBIF is called
If the retrieval is successful, the species will be added immediately. If the species cannot be found in GBIF or the family is not listed in Observation.org, you can still request the species here.
This is https://old.observation.org/add_species.php the link to add species. Use it wisely.

 If the GBIF api did not work out:
Post an entry in this topic

Your request should contain with at least the following data:

1. Species group as known in Observation.org
2. Scientific name
3. Author and year (use the correct punctuation marks)
4. Family name as known in Observation.org
5. Source of this information (taxonomic website)

It is optional to add names for the species in e.g. Dutch or English.

For example :
Other Arthropods (Arthropoda)
Bourletiella hortensis
(Fitch, 1863)
Bourletiellidae

If the taxonomic family of the species is not known in Observation.org include a link to a taxonomic tree of the new species.

* For birds we use the taxonomy as found on IOC worldbirdlist http://www.worldbirdnames.org/ (Birds are up-to-date and every 6 months updated by Maarten Hotting and Erik van Dijk according new IOC updates. In theory only errors occur.)
* For plants we use https://powo.science.kew.org/ as a reference
* For mammals, reptiles and amfibians we use http://www.iucnredlist.org/ as a reference
* For Fish we use http://www.fishbase.de/ as a reference
* For other marine species we use http://www.marinespecies.org as a reference
Was getekend Hisko de Vries.

Wil je een fotovraag stellen op het forum lees dan dit eerst https://forum.waarneming.nl/smf/index.php?topic=452369.0

hiskodevries

#1
The Gbif api : for example for Leucauge grata: test https://api.gbif.org/v1/species/search?q=Leucauge%20grata
We only use the 'best' result , for matching the cannonical name is used
Was getekend Hisko de Vries.

Wil je een fotovraag stellen op het forum lees dan dit eerst https://forum.waarneming.nl/smf/index.php?topic=452369.0

hiskodevries

#2
Peter. see the first post
CiteerBirds, mammals and plants are excluded from this system
Our taxonomists are generating the last taxonomic lists from World Checklist of Vascular Plants, version 10
so keep patience. (if Cirsium greimleri is on this list)
Was getekend Hisko de Vries.

Wil je een fotovraag stellen op het forum lees dan dit eerst https://forum.waarneming.nl/smf/index.php?topic=452369.0

hiskodevries

#3
ik heb de source wat aangepast zodat de meest passende wordt opgehaald. ik ben benieuwd of nu nog meer door de gebruikers ingevoerd kan worden.
tot nu toe heeft deze procedure 3499 soort aanvragen bespaard
Was getekend Hisko de Vries.

Wil je een fotovraag stellen op het forum lees dan dit eerst https://forum.waarneming.nl/smf/index.php?topic=452369.0

bruijsten

graag toevoegen:

nachtvlinders & micro's:

Cyana delicata - (Walker, 1854)
Familie: Erebidae
Link: https://www.afromoths.net/species/show/29389

Hartelijk dank weer (niet verschenen bij 'do it yourself')

hiskodevries

Citaat van: Bart van Hoogstraten op maart 28, 2023, 17:16:45 PMHet lukt me niet om Sphendononema guildingii aan te maken met dat nieuwe systeem.

Chilopoda (Centipedes)
Orde: Scutigeromorpha
Genus: Sphendononema
Soort: S. guildingii (Newport, 1845)

Bron: https://www.jungledragon.com/specie/12492/sphendononema_guildingii.html
Het betreft deze waarneming: https://observation.org/observation/265875747/
:wrong: missende gegevens
Was getekend Hisko de Vries.

Wil je een fotovraag stellen op het forum lees dan dit eerst https://forum.waarneming.nl/smf/index.php?topic=452369.0

hiskodevries

Citaat van: bruijsten op maart 28, 2023, 21:27:43 PMCyana delicata
Je moet mij toch eens uitleggen wat bij jouw fout gaat ? want zonder problemen door de procedure
Was getekend Hisko de Vries.

Wil je een fotovraag stellen op het forum lees dan dit eerst https://forum.waarneming.nl/smf/index.php?topic=452369.0

Pieter Van Dorsselaer

Goeiemorgen,
Graag deze toevoegen voor .be bij Algen, wieren en eencelligen:
Monostroma bullosum (Roth) Thur.
familie: Gomontiaceae
https://www.gbif.org/species/7360407
https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=145939
Groeten,
Pieter

hiskodevries

Citaat van: Pieter Van Dorsselaer op maart 29, 2023, 11:33:17 AMfamilie: Gomontiaceae
vreemd dat beide links als familie Monostromataceae doorgeven
deze toegevoegd en de soort aangemaakt
Was getekend Hisko de Vries.

Wil je een fotovraag stellen op het forum lees dan dit eerst https://forum.waarneming.nl/smf/index.php?topic=452369.0

Bart van Hoogstraten

Citaat van: hiskodevries op maart 29, 2023, 07:54:54 AM
Citaat van: Bart van Hoogstraten op maart 28, 2023, 17:16:45 PMHet lukt me niet om Sphendononema guildingii aan te maken met dat nieuwe systeem.

Chilopoda (Centipedes)
Orde: Scutigeromorpha
Genus: Sphendononema
Soort: S. guildingii (Newport, 1845)

Bron: https://www.jungledragon.com/specie/12492/sphendononema_guildingii.html
Het betreft deze waarneming: https://observation.org/observation/265875747/
:wrong: missende gegevens

Klopt het zo wel?

Arthropoda
Sphendononema guildingii
(Newport, 1845)
Pselliodidae
Vriendelijke groet! Bart van Hoogstraten

De toekomst van Waarneming is onzeker. Draag bij aan het voortbestaan en betaal gewoon jaarlijks € 25,- abonnementskosten!
https://waarneming.nl/donate/

hiskodevries

jawel, de familie toegevoegd en toen werkte de procedure add_species
Was getekend Hisko de Vries.

Wil je een fotovraag stellen op het forum lees dan dit eerst https://forum.waarneming.nl/smf/index.php?topic=452369.0

bruijsten

graag toevoegen:

Kevers

Xystrocera vittata - (Fabricius, 1793)
Familie: Cerambycidae
Link: https://www.gbif.org/species/1128145

Heel merkwaardig: ik vind de soort niet in de database van observado, ook verschijnt hij niet bij de 'do it yourself' toevoegmogelijkheid, maar via internet vind ik 'm toch wel in de GBIF database!

Groet, Pieter

hiskodevries

Citaat van: bruijsten op maart 31, 2023, 10:53:20 AMXystrocera vittata
wederom prima kunnen toevoegen met de beschreven procedure
nog een keer voor Pieter, je start https://old.observation.org/add_species.php
vult naam in zonder spaties voor en na de naam , zonder auteur, zonder jaartal etc
Was getekend Hisko de Vries.

Wil je een fotovraag stellen op het forum lees dan dit eerst https://forum.waarneming.nl/smf/index.php?topic=452369.0

bruijsten

precies hetzelfde gedaan! waarom het dan toch niet werkte, weet ik niet. Eerder vaak genoeg gedaan mét succes. Maar dank voor het toevoegen. Groet, Pieter

DJHiker

Graag toevoegen, staan nog niet in GBIF:

soortgroep: kevers
fam: Chrysomelidae
soort: Omophoita equestris  Fabricius, 1787
bron: https://ala-bie.sibbr.gov.br/ala-bie/species/177746

soortgroep: dagvlinders
fam: Hesperiidae
soort: Heliopetes elonmuski  Grishin, 2023  (geen aprilgrapski)
bron1: https://www.butterfliesofamerica.com/L/heliopetes_elonmuski_types.htm
bron2: https://centerforsystematicentomology.org/insectamundi/0969_Zhang_etal_2023.pdf

dank,
David
David Kohl

hiskodevries

Was getekend Hisko de Vries.

Wil je een fotovraag stellen op het forum lees dan dit eerst https://forum.waarneming.nl/smf/index.php?topic=452369.0

DJHiker

Beste Hisko,
Als ik met de nieuwe "doe het zelf"-methode probeer een soort aan te maken die al voorkomt in de Waarneming/Observation database krijg ik normalerwijs de melding "already exists".
Echter, regelmatig is dat ook niet het geval en krijg in plaats daarvan de melding dat een ondersoort hiervan (die ik helemaal niet heb ingegeven) niet in GBIF voorkomt terwijl dat voor de soort zelf wel het geval is. Een voorbeeld:
Vettius cornya (dagvlinder, Hesperiidae)
Melding op de Doe het zelf-pagina:
vettius%20coryna ACCESSING GBIF
finding for this level: ERROR: species Vettius coryna catargyra not found in GBIF or not accepted or family '.x.' not found

Link Observation.org: https://observation.org/waarneming/view/155593489
Link GBIF: https://www.gbif.org/species/1949112

Een vergelijkbare foutmelding kom ik ook tegen als ik probeer een soort die nog niet in Observation aanwezig is in te voeren, zoals:
Lon zabulon (dagvlinder, Hesperiidae)
Melding op de Doe het zelf-pagina:
lon%20zabulon ACCESSING GBIF
finding for this level: ERROR: species Lon not found in GBIF or not accepted or family '.x.' not found

Maar in GBIF is deze soort wel degelijk aanwezig.
Link GBIF: https://www.gbif.org/species/11654707
David Kohl

hiskodevries

Was getekend Hisko de Vries.

Wil je een fotovraag stellen op het forum lees dan dit eerst https://forum.waarneming.nl/smf/index.php?topic=452369.0

DJHiker

zeker vreemd, want als ik het nogmaals probeer krijg ik nog steeds dezelfde foutmelding, dus er was gisteren geen sprake van een tijdelijke communicatiestoring o.i.d.
Gebruik van een andere browser (Edge i.p.v. Chrome) geeft ook hetzelfde resultaat. Wat opvalt is dat in de foutmelding wordt aangegeven dat de soort Lon (en niet Lon zabulon zoals ingevoerd) niet in GBIF gevonden is. Ook in het voorbeeld van Vettius coryna staat in de error melding niet exact de soort die heb ingegeven, nl. Vettius coryna catargyra i.p.v. Vettius coryna zoals ingegeven, misschien is dat een aanknopingspunt.

Nog een voorbeeld waarbij het niet goed lijkt te gaan:
Luthrodes pandava (dagvlinder, Lycaenidae)
Ook bij deze soort krijg ik een foutmelding:
luthrodes%20pandava ACCESSING GBIF
finding for this level: ERROR: species not found in GBIF or not accepted or family '.x.' not found
(opvallend is dat in dit voorbeeld de soortnaam zelf niet in de foutbevestiging herhaald wordt)
maar de soort is wel te vinden in GBIF: https://www.gbif.org/species/10581870
David Kohl

hiskodevries

voor https://api.gbif.org/v1/species/search?q=Luthrodes%20pandava spelen andere zaken. daar kan geen accepted species worden gevonden met een auteur en juiste familie. Wel een synoniem
Die link is leesbaar in firefox, niet in chrome
Verder moet je zorgen dat de soortnaam zonder leestekens, ook onzichtbare wordt ingevuld.
Gemiddeld worden per dag tussen de 10-100 soorten met deze prodecure ingevoerd. Die werkt best wel redelijk. Niet 100 % natuurlijk
Was getekend Hisko de Vries.

Wil je een fotovraag stellen op het forum lees dan dit eerst https://forum.waarneming.nl/smf/index.php?topic=452369.0

margaux

Ik probeerde de soort Phaeotremella frondosae toe te voegen, maar kreeg de foutmelding dat de familie Phaeotremellaceae nog niet in het systeem zit.

Zou het mogelijk zijn de familie en soort toe te voegen?

Ook de soort Bruine trilzwam - Tremella foliacea is ondertussen ondergebracht in het genus Phaeotremella en de familie Phaeotremellaceae.

Alvast bedankt!

Bron: Spirin, V., Malysheva, V., Yurkov, A. et al. Studies in the Phaeotremella foliacea group (Tremellomycetes, Basidiomycota). Mycol Progress 17, 451–466 (2018). https://doi.org/10.1007/s11557-017-1371-4

hiskodevries

Was getekend Hisko de Vries.

Wil je een fotovraag stellen op het forum lees dan dit eerst https://forum.waarneming.nl/smf/index.php?topic=452369.0

Tobias Seifert

Dear Administrators,

I would like to request the addition of a genus. I could not create it myself.

Information:

Beetles (Coleoptera)
Disphericus
G.R.Waterhouse, 1842
Carabidae

https://www.gbif.org/species/4753044/treatments
https://www.catalogueoflife.org/data/taxon/8KWQD

thank you in advance!

Best regards,
Tobias
Tobias Seifert
Validator for Beetles (Coleoptera) Germany & Austria 🪲 🇩🇪 🇦🇹
https://observation.org/users/169089/

Douwe van der Ploeg

Douwe van der Ploeg


Douwe van der Ploeg

Douwe van der Ploeg

Micha annoff

Graag toevoegen voor observation:
Soortgroep: geleedpotigen overig
Familie: Kiwaidae.
Soort: Kiwa tyleri
Auteur: Thatje in Thatje, Marsh, Roterman, Mavrogortdato & Linse, 2015
Zeldzaamheid: onbekend.
Bron: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=850310

Micha annoff

Graag toevoegen:
1
Soortgroep: overige ongewervelden.
Familie: Actiniidae
Soort: Stylobates calcifer
Auteur: Yoshikawa & Izumi, 2022
Bron: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=1619251&from=rss
Zeldzaamheid: onbekend.
2
Soortgroep: geleedpotigen overig.
Familie: Amaronothridae.
Soort: Ameronothrus retweet
Auteur: Pfingstl & Shimano, 2022
Bron: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=1591786&from=rss
Zeldzaamheid: zeer zeldzaam.
3
Soortgroep: overige ongewervelden.
Familie: Torquaratoridae.
Soort: Yoda demiankoopi
Auteur: Holland, Hiley & Rouse, 2022
Bron: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=1646244&from=rss
Zeldzaamheid: onbekend.

4  Soortgroep: overige ongewervelden.
Familie: Torquaratoridae
Soort: Yoda purpurata
Auteur: Priede et al. 2012
Bron: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=708677

Micha annoff

Citaat van: Micha annoff op april 12, 2023, 20:40:39 PMGraag toevoegen:
1
Soortgroep: overige ongewervelden.
Familie: Actiniidae
Soort: Stylobates calcifer
Auteur: Yoshikawa & Izumi, 2022
Bron: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=1619251&from=rss
Zeldzaamheid: onbekend.
2
Soortgroep: geleedpotigen overig.
Familie: Amaronothridae.
Soort: Ameronothrus retweet
Auteur: Pfingstl & Shimano, 2022
Bron: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=1591786&from=rss
Zeldzaamheid: zeer zeldzaam.
3
Soortgroep: overige ongewervelden.
Familie: Torquaratoridae.
Soort: Yoda demiankoopi
Auteur: Holland, Hiley & Rouse, 2022
Bron: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=1646244&from=rss
Zeldzaamheid: onbekend.

4  Soortgroep: overige ongewervelden.
Familie: Torquaratoridae
Soort: Yoda purpurata
Auteur: Priede et al. 2012
Bron: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=708677

Micha annoff

Soortgroep: reptielen en amfibieën.
Familie: Microhylidae
Soort: Paedophryne swiftorum
Auteur: Rittmeyer, Allison, Gründler, Thompson & Austin, 2012
Zeldzaamheid: onbekend.
Bron is https://nl.m.wikipedia.org/wiki/Paedophryne_swiftorum maar is wel een geaccepteerde soort.